Raquel Cardoso de Melo-Minardi

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Wagner Meira, Jr.Professor of Computer Science, Universidade Federal de Minas Gerais, BrazilDirección de correo verificada de dcc.ufmg.br
Carlos Henrique da SilveiraProfessor, Federal University of Itajuba - UNIFEIDirección de correo verificada de unifei.edu.br
Diego MarianoLecturer at UFMGDirección de correo verificada de ufmg.br
Sabrina de Azevedo SilveiraProfessor at Department of Computer Science, Universidade Federal de ViçosaDirección de correo verificada de ufv.br
Lucianna Helene Silva SantosInstitut Pasteur de MontevideoDirección de correo verificada de pasteur.edu.uy
Goran NeshichEmbrapa Agricultural InformaticsDirección de correo verificada de embrapa.br
Alexandre Victor FassioFederal University of Minas GeraisDirección de correo verificada de ufmg.br
Pedro Magalhães MartinsDoutorando em bioinformática, Universidade Federal de Minas GeraisDirección de correo verificada de dcc.ufmg.br
Valdete AlmeidaD.Sc. BioinformaticsDirección de correo verificada de dcc.ufmg.br
Karine BastardResearcher in Structural Bioinformatics, Genoscope, CEADirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
Julio CD LopesDepartamento de Quimica - UFMGDirección de correo verificada de ufmg.br
Vergne-VaxelaireGénomique Métabolique, Genoscope, Institut François Jacob, CEA, CNRS, Univ Evry, UPSaclayDirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
Anne ZaparuchaGenomique Metabolique Genoscope Universite Paris-Saclay Univ EvryDirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
Adriano WerhliLecturer of Computer Science, Universidade Federal do Rio Grande - FURGDirección de correo verificada de furg.br
David VallenetCEA - Genoscope - UMR8030 - LABGeMDirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
Véronique de BerardinisGenoscope (CEA)Dirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
Claudine MEDIGUECEA/IG/Genoscope & CNRS UMR8030Dirección de correo verificada de genoscope.cns.fr
José Gilberto JardinePesquisador A EMBRAPADirección de correo verificada de embrapa.br
Sergio D PenaProfessor of Biochemistry and Genetics, Universidade Federal de Minas GeraisDirección de correo verificada de dcc.ufmg.br
Raquel PratesProfessor of Computer Science, Federal University of Minas Gerais (UFMG)Dirección de correo verificada de dcc.ufmg.br

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Raquel Cardoso de Melo-Minardi

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A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing J Qin, R Li, J Raes, M Arumugam, KS Burgdorf, C Manichanh, T Nielsen, ... nature 464 (7285), 59-65, 2010	12983	2010
Enterotypes of the human gut microbiome M Arumugam, J Raes, E Pelletier, D Le Paslier, T Yamada, DR Mende, ... Nature 473 (7346), 174-180, 2011	8124	2011
Revealing the hidden functional diversity of an enzyme family K Bastard, AAT Smith, C Vergne-Vaxelaire, A Perret, A Zaparucha, ... Nature chemical biology 10 (1), 42-49, 2014	130	2014
Protein cutoff scanning: A comparative analysis of cutoff dependent and cutoff free methods for prospecting contacts in proteins CH da Silveira, DEV Pires, RC Minardi, C Ribeiro, CJM Veloso, ... Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 74 (3), 727-743, 2009	105	2009
Cutoff Scanning Matrix (CSM): structural classification and function prediction by protein inter-residue distance patterns DEV Pires, RC de Melo-Minardi, MA dos Santos, CH da Silveira, ... BMC genomics 12, 1-11, 2011	85	2011
aCSM: noise-free graph-based signatures to large-scale receptor-based ligand prediction DEV Pires, RC de Melo-Minardi, CH da Silveira, FF Campos, W Meira Jr Bioinformatics 29 (7), 855-861, 2013	65	2013
Familial STAG2 germline mutation defines a new human cohesinopathy FC Soardi, A Machado-Silva, ND Linhares, G Zheng, Q Qu, HB Pena, ... NPJ genomic medicine 2 (1), 7, 2017	55*	2017
A guide to performing systematic literature reviews in bioinformatics DCB Mariano, C Leite, LHS Santos, REO Rocha, RC de Melo-Minardi arXiv preprint arXiv:1707.05813, 2017	53	2017
Identification of subfamily-specific sites based on active sites modeling and clustering RC de Melo-Minardi, K Bastard, F Artiguenave Bioinformatics 26 (24), 3075-3082, 2010	50	2010
nAPOLI: a graph-based strategy to detect and visualize conserved protein-ligand interactions in large-scale AV Fassio, LH Santos, SA Silveira, RS Ferreira, RC de Melo-Minardi IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics 17 (4 …, 2019	41	2019
GASS: identifying enzyme active sites with genetic algorithms SC Izidoro, RC de Melo-Minardi, GL Pappa Bioinformatics 31 (6), 864-870, 2015	41	2015
Characterization of glucose-tolerant β-glucosidases used in biofuel production under the bioinformatics perspective: A systematic review DCB Mariano, C Leite, LHS Santos, LF Marins, KS Machado, AV Werhli, ... Genet Mol Res 16 (3), 10.4238, 2017	33	2017
The Star STING server: a multiplatform environment for protein structure analysis. G Neshich, I Mazoni, SRM Oliveira, MEB Yamagishi, PR Kuser-Falcao, ... Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 4, p. 717-722, 2006., 2006	31	2006
Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. RC Melo, C Ribeiro, CS Murray, CJM Veloso, CH da Silveira, G Neshich, ... Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 946-963, 2007., 2007	30	2007
Propedia: a database for protein–peptide identification based on a hybrid clustering algorithm PM Martins, LH Santos, D Mariano, FC Queiroz, LL Bastos, IS Gomes, ... BMC bioinformatics 22, 1-20, 2021	29	2021
Molecular dynamics gives new insights into the glucose tolerance and inhibition mechanisms on β-glucosidases LSC Costa, DCB Mariano, REO Rocha, J Kraml, CH Silveira, KR Liedl, ... Molecules 24 (18), 3215, 2019	26	2019
Introducing programming skills for life science students D Mariano, P Martins, L Helene Santos, RC de Melo‐Minardi Biochemistry and Molecular Biology Education 47 (3), 288-295, 2019	24	2019
Enterotypes of the human gut microbiome GR Fernandes, J Tap, T Bruls, JM Batto, M Bertalan, N Borruel, F Casellas, ... Nature 473 (7346), 174180, 2011	23	2011
MetaHIT M Arumugam, J Raes, E Pelletier, D Le Paslier, T Yamada, DR Mende, ... Consortium, Antolín, M., Artiguenave, F., Blottiere, HM, Almeida, M …, 0	23*
Protein structural bioinformatics: An overview V de Almeida Paiva, I de Souza Gomes, CR Monteiro, MV Mendonça, ... Computers in Biology and Medicine 147, 105695, 2022	21	2022

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